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Rmesplot

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RMESPlot devient JR'MES

L'utilité principale de RmesPlot était de faciliter l'exploitation de fichiers de résultats générés par R'MES. Or, l'enrichissement fonctionnel de ce dernier avait conduit à rendre explosive la combinatoire de ses options et arguments, rendant parfois délicate la composition de la ligne de commande. Maintenant que R'MES est distribué pour des systèmes d'exploitation ciblant des utilisateurs peu familiers avec les outils en ligne de commande, il est devenu pertinent de mettre à disposition de tous une interface graphique permettant tout à la fois le paramétrage de R'MES et son lancement, ainsi que l'exploration visuelle des résultats produits : J'RMES.

J'RMES en bref

Le fonctionnement de J'RMES est détaillé dans son guide d'utilisation (en cours de finalisation), mais en résumé, il offre trois modes de fonctionnement :

  • un mode de définition des paramètres de lancement de R'MES et d'exécution de ce dernier :
    • dans ce mode, l'utilisateur peut spécifier toutes les entrées pour R'MES (séquence à analyser, méthode d'approximation, longueur de mots ou fichier de familles...) avant de lancer R'MES.
  • un mode d'exploration de résultats de R'MES :
    • ce mode reprend l'intégralité des fonctionnalités présentes dans RMESPlot.
  • un mode de génération de fichiers de familles utilisables avec (J')RMES :
    • grâce à ce dernier mode, l'utilisateur renseigne les caractéristiques des familles qu'il souhaite générer et peut ensuite lancer la génération par elle-même.

Disponibilité de JR'MES

Encore en phase de validation, la version actuellement disponible de J'RMES peut être considérée comme «béta». Bien qu'ayant été testée, des dysfonctionnements sont encore à prévoir avec cette version, et il est déconseillé de l'utiliser en production. Pour l'exploration de fichiers générés par R'MES, il est toujours préférable de recourir à RmesPlot. Les deux outils sont disponibles en téléchargement à l'adresse http://mulcyber.toulouse.inra.fr/frs/?group_id=38

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