Bibliothèque d'échantillons

Parcourir | Soumettre un nouvel échantillon | Créer un paquet

fastq_1-0_to_1-5

Type:
Scripts complets
Category:
Autre
License:
GNU General Public License
Language:
Perl
 
Description:
Convert a fastq from Sanger to Illumina's format (quality coded on ASCII+33 -> ASCII+64)
Just inverse the "tr" statement to convert from 1.5 (illumina) to 1.0 (sanger)
Requires a 4-lines formatted fastq: no line wrap in sequence nor quality.

Versions de cet échantillon

Numéro d'identification de l'échantillon Téléchargement Date d'envoi Auteur Effacer
20.125/02/2011 12:45nicolas allias

Téléchargez une version en texte brut du code en cliquant sur "Download Version"

 


Dernière version d'échantillon : 0.1

#!/usr/bin/perl use strict; use warnings; my $cptr =1; while (<>) { if ($cptr%4==0) { $_ =~ tr/\x21-\xe0\x21/\x40-\xff\x00-\x3f/; } print $_; $cptr+=1; }

Soummetre une nouvelle version

Vous pouvez fournir une nouvelle version de cet échantillon si vous l'avez modifié et que vous trouvez bien de le partager avec les autres..

Powered By FusionForge